Para usuários Windows

Windows

Se você é usuário de Windows, terá que ativar a função do Windows Subsystem Linux 2 (WSL2).

Para tal, siga as intruções do tutorial
obs1: Escolha instalar o Ubuntu 22.04 LTS.

Abra o terminal Ubuntu como o da imagem abaixo e digite o seguinte comando

sudo apt-get install bc

Após a devida configuração do WSL2 e instalação do Ubuntu, agora você precisa instalar o software Docker Desktop. Baixe o instalador aqui

Após a instalação do Docker Desktop, também é necessário instalar um módulo do docker no terminal WSL2. Abra o terminal do Ubuntu e digite o seguinte comando:

sudo apt-get install docker.io

Após tudo configurado, baixe os scripts da ferramenta PIMBA para seu computador. Os scripts podem ser baixados nense link

Salve o arquivo baixado em uma pasta no seu computador. Minha sugestão é que você crie uma pasta chamada disciplina_metabarcoding e guarde os arquivos baixados nela.

Após descompactar o arquivo baixado do PIMBA, descompacte-a (clicando com o botão direito e selecionando a opção de desompactar).Você vai precisar dar permissão de execução para os arquivos dessa pasta. Para isso, faça o seguinte:

Entre no diretório onde está a pasta:

cd disciplina_metabarcoding/

Liste se a pasta baixada e descompactada está realmente presente:

ls

Vendo que tudo está certo, dê o seguinte comando para habilitar o modo de execução dos arquivos do PIMBA:

chmod -R +x pimba_main